Simon István (MTA-TTK Enzimológiai Intézet)
Fehérje szerkezetek bioinformatikai és statisztikus fizikai vizsgálata

A múlt század utolsó évtizedében egyidejűleg két nagy tudományos áttörés történt, amiből az egyik az igényt a másik a lehetőséget teremtette meg, létrehozva egy új tudományágat a bioinformatikát. A genom projektek, különösen a humán genom program az élettudományok területén eddig nem látott adat mennyiségeket eredményezett, aminek feldolgozása lehetetlen lett volna megfelelő számítástechnikai háttér nélkül. Ezzel egyidejűleg jelent meg az internet és a világháló, ami lehetővé tette az adat források összekapcsolását és az adatok feldolgozását. A szekvencia meghatározások, technikai okok miatt nem közvetlenül a fehérjéken, hanem az azokat kódoló nukleinsavakon történtek. Így azoknak a fehérjéknek is megismerték az aminosav sorrendjét, amit nehéz lett volna tiszta állapotban előállítani, tipikusan ilyenek a membránba ágyazott fehérjék, sőt olyanokét, is mint a rendezetlen fehérjék, aminek a létezéséről nem is tudtunk.
Előadásomban diákjaimmal ezen a területen végzett tevékenységemről számolok be. A bioinformatika nem csak a kutatási eszköz tárat bővíti. Elég csak a transzmembrán fehérjék topológia szerveződése vagy a rendezetlen és kötödés hatására rendeződő fehérje szegmensek szerkezet szerveződését leíró, előadásomban ismertetendő, lényegében statisztikus termodinamikai összefüggések feltárására gondolni, ahhoz, hogy belássuk, ezek a munkák a fehérje tudomány fontos kérdéseinek megválaszolásához járulnak hozzá. Ráadásul, nem csak adatokat tudunk közölni, amit mások felhasználhatnak munkájukban, azaz nem csak halat adunk a többieknek, hanem hálót is amivel maguknak megszerezhetik a mások által még nem publikált információkat. Ennek jegyében telepítettünk 17 szervert a világhálóra.

További információ: https://fizika.elte.hu/hu/index.php?page=ajanlat&id=140